La Librairie Le Pigeonnier a été fondée en 1999 par Françoise Zylberberg, dite « Zyl », alors professeur de français à l'Université nationale de Taïwan. Pendant les 30 ans qu'elle a vécus à Taipei, Zyl n'a eu de cesse de partager son amour du livre et de la culture française. Son œuvre se poursuit aujourd'hui sous la direction de Sophie Hong Li-Fen, styliste et partenaire de Zyl jusqu'à son décès en 2010, qui a participé à la fondation de la librairie.
Le Pigeonnier n'est pas seulement la seule librairie francophone de Taipei, c'est aussi un espace de rencontre entre les auteurs et les lecteurs, avec des soirées de lecture, des conférences et des événements artistiques réguliers. La librairie comporte aujourd'hui environ 16 000 titres, du beau livre aux méthodes de langue en passant par la littérature française ou chinoise - entre autres -, la bande dessinée, les sciences sociales, les livres de recette ou jeunesse, mais aussi la musique et le cinéma. La librairie accueille les nouveautés dans ces différents domaines toutes les deux semaines, et propose un système de commande pour tous types d'ouvrages sans supplément.
En 2013, Le Pigeonnier a obtenu l'agrément Librairie francophone de référence, attribué par le Centre national du livre (CNL). Elle est présente chaque année au Salon international du livre de Taipei (TIBE), où elle collabore avec le Bureau international de l'édition française (BIEF) et le Bureau français de Taipei pour organiser les ventes, les conférences et les dédicaces des auteurs invités. Après 2001, 2006 et 2010, la France est de nouveau le pays invité d'honneur au TIBE en 2022.